С момента начала пандемии новой коронавирусной инфекции научными учреждениями Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, с учетом их специализации, была развернута работа по изучению возбудителя и его проявлений, имеющих значение для защиты здоровья людей.

За 2020-2021 гг. ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор» Роспотребнадзора опубликовано 18 статей по вопросам, связанным с COVID-19, без учета препринтов и тезисов российских и международных конференций. Значительная часть статей опубликована в высокорейтинговых англоязычных журналах, таких как Vaccines (импакт-фактор (ИФ) – 4,086), Eurosurveillance (ИФ – 6,454), Frontiers in Molecular Biosciences (ИФ – 4,188), Photodiagnosis and Photodynamic Therapy (ИФ – 2,894) и ряде других.

Совместно с европейскими специалистами опубликованы данные о первых случаях SARS-CoV-2 [1] и генетических характеристиках вирусов SARS-CoV-2, распространявшихся в Европейском регионе ВОЗ в первой половине 2020 года [2], подготовлен анализ эпидситуации в Российской Федерации и влияния противоэпидемических мер на циркуляцию сезонного гриппа [3]. В ряде публикаций рассмотрены свойства SARS-CoV-2 [4, 5], включая жизнеспособность вируса и подходы к его инактивации и ингибированию в рамках разработки лекарственных препаратов [6, 7, 8, 9, 10].

Пристальное внимание в серии публикаций уделено профессиональной заболеваемости и обеспечению безопасности труда медицинских работников [11]. Изучен ряд клинических аспектов коронавирусной инфекции, включая факторы, влияющие на тяжесть болезни, последствия конинфицирования SARS-CoV-2 и другими респираторными вирусами, например, вирусом гриппа, особенности формирования иммунитета в зависимости от клинических проявлений [12], а также продолжительность персистенции вируса.

В публикациях представлен уникальный опыт создания первых в стране тест-систем для диагностики SARS-CoV-2 и выявления антител у лиц, перенесших заболевание. Описано применение метода цифровой ПЦР и ПЦР в реальном времени для диагностики COVID-19 у лиц с симптомами и без клинических проявлений [13].

Ключевой теме разработки вакцин против COVID-19 посвящены шесть публикаций (включая пять статей), охватывающих проблематику мультиплатформенного подхода к созданию вакцин и описывающих ряд перспективных платформ, среди которых – РНК-вакцины [14, 15] и вакцины на основе вирусных векторов [16]. В двух публикациях [17, 18] дается характеристика иммуногенных и протективных свойств пептидной вакцины «ЭпиВакКорона» и описываются предварительные результаты простого слепого плацебо-контролируемого рандомизированного исследования безопасности, реактогенности и иммуногенности вакцины «ЭпиВакКорона» для профилактики COVID-19 на добровольцах в возрасте 18–60 лет (фаза I–II).

ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор» Роспотребнадзора продолжает изучение вируса SARS-CoV-2 и подготовку новых публикаций.

Перечень публикаций сотрудников Центра по теме «Коронавирус»

(по состоянию на 24.06.21 г.)

Статьи

1. Spiteri G., Fielding J., Diercke M., Campese C., Enouf V., Gaymard A., Bella A., Sognamiglios P., Sierra Moros M.J., Riutort A.N., Demina Y.V., Mahieu R., Broas M., Bengner M., Buda S., Schilling J., Filleul L., Lepoutre A., Saura C., Mailles A., Levy-Bruhl D., Coignard B., Bernard-Stoecklin S., Behillil S., van der Werf S., Valette M., Lina B., Riccardo F., Nicastri E., Casas I., Larrauri A., Salom Castell M., Pozo F., Maksyutov R.A., Martin C., Van Ranst M., Bossuyt N., Siira L., Sane J., Tegmark-Wisell K., Palmerus M., Broberg E.K., Beaute J., Jorgensen P., Bundle N., Pereyaslov D., Adlhoch C., Pukkila J., Pebody R., Olsen S., Ciancio Bruno C. First cases of coronavirus disease 2019 (COVID-19) in the WHO European Region, 24 January to 21 February 2020 // Eurosurveillance. 2020. V. 25. № 9. P. 2-7.

https://www.eurosurveillance.org/content/10.2807/1560-7917.ES.2020.25.9.2000178?crawler=true

2. Alm E., Broberg E.K., Connor T., Hodcroft E.B., Komissarov A.B., Maurer-Stroh S., Melidou A., Neher R.A., O’Toole Á., Pereyaslov D., The WHO European Region sequencing laboratories and GISAID EpiCoV group. Geographical and temporal distribution of SARS-CoV-2 clades in the WHO European Region, January to June 2020 // Eurosurveillance. 2020. V. 25. N.32.

https://www.eurosurveillance.org/content/10.2807/1560-7917.ES.2020.25.32.2001410?crawler=true

3. Ilyicheva T.N., Gureyev V.N. The impact of anti-epidemic measures against coronavirus disease 2019 (COVID-19) on the seasonal influenza epidemic // Chinese Medical Journal. 2021. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8104270/

4. Ryzhikov A.B., Onkhonova G.S., Imatdinov I.R., Gavrilova E.V., Maksyutov R.A., Gordeeva E.A., Pazynina G.V., Ryzhov I.M., Shilova N.V., Bovin N.V. Recombinant SARS_CoV_2 S Protein Binds to Glycans of the Lactosamine Family in vitro // Biochemistry (Moscow). 2021.

https://link.springer.com/article/10.1134/S0006297921030019

5. Ильичева Т.Н. Две пандемии XXI века: COVID-19 и «свиной» грипп 2009 // Медицинская иммунология. 2020. Т. 22. № 6. С. 1036-1044. https://www.mimmun.ru/mimmun/article/view/2048

6. Hafez M., Popov A.I., Zelenkov V.N., Teplyakova T.V., Rashad M. Humic substances as an environmental- friendly organic wastes potentially help as natural anti-virus to inhibit COVID-19 // Science Archives. 2020. V. 1. P. 53-60.

http://sciencearchives.org/wp-content/uploads/2020/09/Science-Archives-2020-Vol.-1-2-53-60.pdf

7. Dolskiy A.A., Bodnev S.A., Nazarenko A.A., Smirnova A.M., Pyankova O.G., Matveeva A.K., Grishchenko I.V., Tregubchak T.V., Pyankov O.V., Ryzhykov A.B., Gavrilova E.V., Maksyutov R.A., Yudkin D. Deletion of BST2 Cytoplasmic and Transmembrane N-Terminal Domains Results in SARS-CoV, SARS-CoV-2 and Influenza Virus Production Suppression in a Vero Cell Line // Frontiers in Molecular Biosciences. 2020. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7847895/

8. Soloveva I.V., Ilyicheva T.N., Marchenko V.Yu., Pyankov O.V., Tochilina A.G., Belova I.V., Zhirnov V.A., Bormotov N.I., Skarnovich M.O., Durymanov A.G., Molodtsova S.B., Filippova E.I., Ovchinnikova A.S., Magerramova A.V., Ryzhikov A.B., Maksyutov R.A. Genome Features and In Vitro Activity against Influenza A and SARS-CoV-2 Viruses of Six Probiotic Strains // BioMed Research International. 2021.

https://downloads.hindawi.com/journals/bmri/2021/6662027.pdf

9. Svyatchenko V.A., Nikonov S.D., Mayorov A.P., Gelfond M.L., Loktev V.B. Antiviral photodynamic therapy: Inactivation and inhibition of SARS-CoV-2 in vitro using methylene blue and Radachlorin // Photodiagnosis and Photodynamic Therapy. 2021. March. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S157210002030466X

10. Сулимов А.В., Шихалиев Х.С., Пьянков О.В., Щербаков Д.Н., Чиркова В.Ю., Ильин И.С., Кутов Д.К., Тащилова А.С., Крысин М.Ю., Крыльский Д.В., толповская Н.В., Волосникова Е.А., Беленькая С.В., Сулимов В.Б. Разработка противовирусных лекарств на основе ингибиторов главной протеазы SARS-CoV-2 // Биомедицинская химия. 2021. Т. 67. № 3. С. 259-267.

http://pbmc.ibmc.msk.ru/ru/article-ru/PBMC-2021-67-3-259/

11. Платонова Т.А., Голубкова А.А., Тутельян А.В., Смирнова С.С. Заболеваемость COVID-19 медицинских работников. Вопросы биобезопасности и факторы профессионального риска // Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. 2021. V. 20. № 2. С.4-11.

https://www.epidemvac.ru/jour/article/view/1220/727

12. Платонова Т. А., Голубкова А. А., Карбовничая Е. А., Смирнова С.С. Особенности формирования гуморального иммунитета у лиц с различными клиническими проявлениями COVID-19 // Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. 2021. V. 20. № 1. С. 20-25.

https://www.epidemvac.ru/jour/article/view/1175

13. Терновой В.А., Лутковский Р.Ю., Пономарева Е.П., Гладышева А.В., Чуб Е.В., Тупота Н.Л., Смирнова А.М., Назаренко А.А., Локтев В.Б., Гаврилова Е.В., Агафонов А.П., Максютов Р.А. Обнаружение РНК SARS-COV-2 в носоглоточных мазках больных COVID-19 и бессимптомных носителей методами цифровой ПЦР И ПЦР в реальном времени // Клиническая лабораторная диагностика. 2020. Т. 65. № 12. С. 785-792. http://www.medlit.ru/journalsview/lab/view/journal/2020/issue-12/2243-obnaruzhenie-rnk-sars-cov-2-v-nosoglotochnyh-mazkah-bol-nyh-covid-19-i-bessimptomnyh-nositeley-metodami-cifrovoy-pcr-i-pcr-v-real-nom-vremeni/

14. Karpenko L.I., Rudometov A.P., Sharabrin S.V., Shcherbakov D.N., Borgoyakova M.B., Bazhan S.I., Volosnikova E.A., Rudometova N.B., Orlova L.A., Pyshnaya I.A., Zaitsev B.N., Volkova N.V., Azaev M.S., Zaykovskaya A.V., Pyankov O.V., Ilyichev A.A. Delivery of mrna vaccine against SARS-COV-2 using a polyglucin: Spermidine conjugate // Vaccines. 2021. V. 9. № 2. P. 1-14.

https://www.mdpi.com/2076-393X/9/2/76

15. Ильичев А.А., Орлова Л.А., Шарабрин С.В., Карпенко Л.И. Технология мРНК как одна из перспективных платформ для разработки вакцины против SARS-CoV-2 // Вавиловский журнал генетики и селекции. 2020. Т. 24. № 7. С. 802-807. https://vavilov.elpub.ru/jour/article/view/2824

16. Зайчук Т.А., Нечипуренко Ю.Д., Аджубей А.А., Оникиенко С.Б., Черешнев В.А., Зайнутдинов С.С., Кочнева Г.В., Нетесов С.В., Матвеева О.В. Проблемы создания вакцин против бетакоронавирусов: антителозависимое усиление инфекции и вирус Сендай как возможный вакцинный вектор // Молекулярная биология. 2020. Т.54. № 6, С. 922-938. https://sciencejournals.ru/view-article/?j=molrus&y=2020&v=54&n=6&a=MolRus2006015Zaichuk

17. Рыжиков А.Б., Рыжиков Е.А., Богрянцева М.П., Усова С.В., Даниленко Е.Д., Нечаева Е.А., Пьянков О.В., Пьянкова О.Г., Гудымо А.С., Боднев С.А., Онхонова Г.С., Слепцова Е.С., Кузубов В.И., Рындюк Н.Н., Гинько З.И., Петров В.Н., Моисеева А.А., Торжкова П.Ю., Пьянков С.А., Трегубчак Т.В., Антонец Д.В., Гаврилова Е.В., Максютов Р.А. Простое слепое плацебо-контролируемое рандомизированное исследование безопасности, реактогенности и иммуногенности вакцины «ЭпиВакКорона» для профилактики COVID-19 на добровольцах в возрасте 18–60 лет (фаза I–II) // Инфекция и иммунитет. 2021. Т. 11. № 2. С. 283-296.

https://www.iimmun.ru/iimm/article/view/1699

18. Рыжиков А.Б., Рыжиков Е.А., Богрянцева М.П., Даниленко Е.Д., Иматдинов И.Р., Нечаева Е.А., Пьянков О.В., Пьянкова О.Г., Суслопаров И.М., Таранов О.С., Гудымо А.С., Данильченко Н.В., Слепцова Е.С., Боднев С.А., Онхонова Г.С., Петров В.Н., Моисеева А.А., Торжкова П.Ю., Пьянков С.А., Трегубчак Т.В., Антонец Д.В., Гаврилова Е.В., Максютов Р.А. Иммуногенные и протективные свойства кандидатной пептидной вакцины против SARS-CoV-2 // Вестник Российской академии медицинских наук. 2021. Т. 76. № 1. С. 5-19.

https://vestnikramn.spr-journal.ru/jour/article/view/1528

Препринты

1. Антонец Д.В., Плоскирева А.А., Поспелов М.В., Смоленский В.Ю. Комплексный анализ и прогноз развития эпидемиологической ситуации по COVID-19 в Российской Федерации (2020-08-31). DOI: 10.21055/preprints-3111803

https://covid19-preprints.microbe.ru/article/107

2. Ivashchenko A.A., Svistunov A.A., Khorobryh T.V., Loginov V.G., Karapetian R.N., Mishchenko N.P., Poyarkov S.V., Volgin M.V., Yakubova E.V., Topr M.P., Pyankov O.V., Magerramova A.V., Tomilov A.A., Ivashchenko A.V. Aprotinin - a New Drug Candidate for The Prevention of SARS-CoV-2 (COVID-19) (2020-09-13). DOI: 10.21055/preprints-3111813 https://covid19-preprints.microbe.ru/article/117

3. Золин В.В., Оськина О.П., Солодкий В.В., Гаврилова Е.В., Агафонов А.П., Максютов Р.А. Изучение жизнеспособности вируса SARS-CoV-2 в питьевой и морской воде (2020-07-20). DOI: 10.21055/preprints-3111723

https://covid19-preprints.microbe.ru/article/27

4. Святченко В.А., Баяндин Р.Б., Брязгин А.А., Золин В.В., Гаврилова Е.В., Агафонов А.П., Максютов Р.А. Оценка эффективности инактивации вируса SARS-CoV-2 на ускорителе ИЛУ-10 (2020-07-22). DOI: 10.21055/preprints-3111731

https://covid19-preprints.microbe.ru/article/35

Тезисы конференций

1. Платонова Т.А., Голубкова А.А., Карбовничая Е.А., Смирнова С.С. Значение репертуара лимфоцитов у пациентов с новой коронавирусной инфекцией в прогнозе тяжести клинических проявлений // Эпидемиологический надзор за актуальными инфекциями: новые угрозы и вызовы: сборник научных трудов Всероссийской научно-практической конференции с международным участием, посвященной 100-летию академика И.Н. Блохиной (26–27 апреля 2021 г., Н. Новгород). С. 69-72. https://www.nniiem.ru/file/sobytiya/100let/sbornik-100-let-blohinoy.pdf

2. Платонова Т.А., Голубкова А.А., Смирнова С.С. Вопросы биобезопасности медицинских работников и их заболеваемость COVID-19 // Эпидемиологический надзор за актуальными инфекциями: новые угрозы и вызовы: сборник научных трудов Всероссийской научно-практической конференции с международным участием, посвященной 100-летию академика И.Н. Блохиной (26–27 апреля 2021 г., Н. Новгород). С. 72-76. https://www.nniiem.ru/file/sobytiya/100let/sbornik-100-let-blohinoy.pdf

3. Ильичева Т.Н. Влияние противоэпидемических мероприятий в отношении COVID-19 на динамику эпидемии сезонного гриппа 2020 г. // VI Конгресс Евро-Азиатского общества по инфекционным болезням. Журнал инфектологии. 2020. Приложение 1. Т. 12. № 2. С. 57.

http://ipoeasid.ru/wp-content/uploads/2020/05/Kongr_EAOIB_2020.pdf

4. Лутковский Р.Ю., Терновой В.А., Пономарева Е.П., Гладышева А.В., Чуб Е.В. Обнаружение РНК SARS-CoV-2 у больных COVID-19 и бессимптомных носителей методами цифровой ПЦР и ПЦР в реальном времени // Сборник тезисов VII Международной конференции молодых ученых: биофизиков, биотехнологов, молекулярных биологов и вирусологов (OpenBio - 2020) / АНО "Инновационный центр Кольцово". Новосибирск: ИПЦ НГУ, 2020. С. 91-92.

https://openbio.ru/openbio_tezis_2020.pdf

5. Чуб Е.В., Пьянков С.А., Терновой В.А., Боднев С.А., Пьянков О.В., Богрянцева М.П., Непомнящих Т.С., Агафонов А.П., Гаврилова Е.В., Максютов Р.А. Разработка и производство первых в России ПЦР и ИФА-тест-систем для диагностики COVID-19 // Материалы Международной научно-практической конференции по вопросам противодействия новой коронавирусной инфекции и другим инфекционным заболеваниям (9-10 декабря 2020 г., Санкт-Петербург). С. 217-219.

https://rusneb.ru/catalog/000200_000018_RU_NLR_BIBL_A_012527563/

6. Платонова Т.А., Голубкова А.А., Скляр М.С., Воробьев А.В., Макарочкина Н.Г., Карбовничая Е.А., Смирнова С.С. Продолжительность персистенции SARS-CoV-2 у лиц с разными клиническими формами заболевания // Контроль и профилактика инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи (ИСМП-2020): сборник тезисов VIII Конгресса с международным участием (25–27 ноября 2020 г., Москва). С. 96. https://expodata.info/wp-content/uploads/2020/11/Tezisy-ISMP-dlya-razmeshheniya-na-sayte.pdf

7. Голубкова А.А., Платонова Т.А., Смирнова С.С. Безопасность медицинских работников в период пандемии COVID-19: субъективные ощущения, универсальные и дополнительные меры предосторожности // Контроль и профилактика инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи (ИСМП-2020): сборник тезисов VIII Конгресса с международным участием (25–27 ноября 2020 г., Москва). С. 27-28. https://expodata.info/wp-content/uploads/2020/11/Tezisy-ISMP-dlya-razmeshheniya-na-sayte.pdf

8. Боднев С.А., Швалов А.Н., Антонец Д.В., Пьянков О.В., Старчевская М.Е., Назаренко А.А., Смирнова А.М., Трегубчак Т.В., Гаврилова Е.В., Максютов Р.А. Генетическая вариабельность SARS-CoV-2, циркулирующего на территории Российской Федерации // Материалы Международной научно-практической конференции по вопросам противодействия новой коронавирусной инфекции и другим инфекционным заболеваниям (9-10 декабря 2020 г., Санкт-Петербург). С. 49-51.

https://rusneb.ru/catalog/000200_000018_RU_NLR_BIBL_A_012527563/

9. Рыжиков А.Б., Святченко В.А., Гудымо А.С., Пьянкова О.Г., Суслопаров И.М., Данильченко Н.В., Моисеева А.А., Колосова Н.П., Буланович Ю.А., Протопопова Е.В., Лудковский Р.Ю., Терновой В.А., Омигов В.В., Таранов О.С., Локтев В.Б., Гаврилова Е.В., Максютов Р.А. Особенности микст-инфекций SARS-CoV-2 и ряда других респираторных вирусов in vitro и in vivo // Материалы Международной научно-практической конференции по вопросам противодействия новой коронавирусной инфекции и другим инфекционным заболеваниям (9-10 декабря 2020 г., Санкт-Петербург). С. 186-188. https://rusneb.ru/catalog/000200_000018_RU_NLR_BIBL_A_012527563/

10. Пьянков О.В., Овчинникова А.С., Магеррамова А.В., Шиповалов А.В., Томилов А.А., Гаврилова Е.В., Максютов Р.А. Изучение вирусологических свойств SARS-CoVа-2 in vitro и in vivo // Материалы Международной научно-практической конференции по вопросам противодействия новой коронавирусной инфекции и другим инфекционным заболеваниям (9-10 декабря 2020 г., Санкт-Петербург). С. 182-184.

https://rusneb.ru/catalog/000200_000018_RU_NLR_BIBL_A_012527563/

11. Гаврилова Е.В., Рыжиков А.Б., Суслопаров И.М., Пьянкова О.Г., Усова С.В., Богрянцева М.П., Пьянков С.А., Даниленко Е.Д., Иматдинов И.Р., Пьянков О.В., Нечаева Е.А., Рыжиков Е.А., Максютов Р.А., Попова А.Ю. Мультиплатформенный подход в разработке вакцин для профилактики вирусных инфекций на примере COVID-19 // Материалы Международной научно-практической конференции по вопросам противодействия новой коронавирусной инфекции и другим инфекционным заболеваниям (9-10 декабря 2020 г., Санкт-Петербург). С. 63-66.

https://rusneb.ru/catalog/000200_000018_RU_NLR_BIBL_A_012527563/

12. Терновой В.А., Лутковский Р.Ю., Пономарева Е.П., Гладышева А.В., Чуб Е.В., Тупота Н.Л., Смирнова А.М., Назаренко А.А., Локтев В.Б., Гаврилова Е.В., Агафонов А.П., Максютов Р.А. Обнаружение РНК SARS-CoV-2 в носоглоточных мазках больных COVID-19 и бессимптомных носителей методами цифровой ПЦР и ПЦР в реальном времени // Социально-значимые и особо опасные инфекционные заболевания: Материалы VII Всероссийской междисциплинарной научно-практической конференции с международным участием (28 октября – 30 октября 2020 г., Сочи). С. 181-182.

https://vk.com/doc593797833_572157798?hash=78e774faebbd51c27d